政府宣布社區疫苗接種中心的運作有新安排，當中5間由私家醫院營運的接種中心11月起關閉，其餘21間延長運作至年底，開放時間亦有所調整。
公務員事務局局長聶德權於9月9日會見傳媒，因應疫苗的供應、接種的需求和速度，政府決定就社區疫苗接種中心運作作，公布以下安排：
（一）由11月開始，有5間社區疫苗接種中心會關閉，分別是養和醫院、養和東區醫療中心、聖保祿醫院、大埔墟體育館和荃景圍體育館。
（二）另外21間社區疫苗接種中心會延長運作至今年底。中心會在10月及11月繼續提供第一針的接種服務，而12月則只會提供第二針的疫苗接種服務。
（三）由11月1日開始，21間社區疫苗接種中心的開放時間會有所調整。逢星期六及星期日的開放時間會維持不變，即由上午8時至晚上8時。星期一、星期二、星期四和星期五的開放時間改為上午10時至下午6時，而星期三全日休息。所有疫苗接種中心運作日的下午1時半至2時半為清潔時間。
聶德權表示，政府已盡量維持開放最多接種中心，兼顧較多市民挑選的接種時段。屆時，社區疫苗接種中心平日每天可提供27,000個接種名額，星期六、日每天則可提供41,000個，加上逾千間私家醫生診所提供科興疫苗接種服務，相信可滿足市民的需求。
在10月和11月提供第一劑疫苗接種服務的21間社區疫苗接種中心如下：
提供科興克爾來福疫苗的接種中心
渣華道體育館
官涌體育館
九龍灣體育館
源禾路體育館
天暉路體育館
提供復星／BioNTech復必泰疫苗的接種中心
中山紀念公園體育館
西灣河體育館
港怡醫院
曉光街體育館
教育局九龍塘教育服務中心
何文田體育館
荔枝角公園體育館
界限街體育館
彩虹道羽毛球中心
龍琛路體育館
香港中文大學醫院
將軍澳體育館
林士德體育館
友愛體育館
元朗體育館
東涌社區會堂